Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxa13Q62424 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxa13Q62424 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxa13Q62424 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxa13Q62424 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxa13Q62424 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxa13Q62424 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxa13Q62424 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxa13Q62424 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxa13Q62424 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hoxa13Q62424 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxa13Q62424 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxa13Q62424 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxa13Q62424 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Hoxa13Q62424 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxa13Q62424 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxa13Q62424 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxa13Q62424 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxa13Q62424 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxa13Q62424 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxa13Q62424 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxa13Q62424 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxa13Q62424 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxa13Q62424 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxa13Q62424 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxa13Q62424 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxa13Q62424 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxa13Q62424 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxa13Q62424 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxa13Q62424 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxa13Q62424 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxa13Q62424 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxa13Q62424 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxa13Q62424 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxa13Q62424 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxa13Q62424 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hoxa13Q62424 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxa13Q62424 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms