Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AtmQ62388 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AtmQ62388 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AtmQ62388 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AtmQ62388 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AtmQ62388 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AtmQ62388 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AtmQ62388 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AtmQ62388 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AtmQ62388 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AtmQ62388 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AtmQ62388 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AtmQ62388 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AtmQ62388 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AtmQ62388 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AtmQ62388 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AtmQ62388 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AtmQ62388 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AtmQ62388 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AtmQ62388 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtmQ62388 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtmQ62388 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AtmQ62388 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AtmQ62388 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AtmQ62388 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AtmQ62388 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AtmQ62388 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AtmQ62388 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AtmQ62388 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtmQ62388 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtmQ62388 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtmQ62388 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtmQ62388 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtmQ62388 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AtmQ62388 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtmQ62388 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtmQ62388 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtmQ62388 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtmQ62388 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtmQ62388 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtmQ62388 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtmQ62388 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtmQ62388 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtmQ62388 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtmQ62388 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtmQ62388 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AtmQ62388 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtmQ62388 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtmQ62388 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtmQ62388 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtmQ62388 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtmQ62388 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtmQ62388 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtmQ62388 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtmQ62388 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtmQ62388 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtmQ62388 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtmQ62388 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtmQ62388 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtmQ62388 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtmQ62388 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtmQ62388 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtmQ62388 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AtmQ62388 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AtmQ62388 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AtmQ62388 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtmQ62388 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtmQ62388 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtmQ62388 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtmQ62388 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtmQ62388 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AtmQ62388 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AtmQ62388 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AtmQ62388 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AtmQ62388 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AtmQ62388 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AtmQ62388 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AtmQ62388 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AtmQ62388 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AtmQ62388 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms