Protein–RNA interactions for Protein: Q62376

Snrnp70, U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp70Q62376 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrnp70Q62376 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrnp70Q62376 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrnp70Q62376 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrnp70Q62376 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrnp70Q62376 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrnp70Q62376 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrnp70Q62376 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrnp70Q62376 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrnp70Q62376 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrnp70Q62376 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrnp70Q62376 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrnp70Q62376 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrnp70Q62376 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms