Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lama3Q61789 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lama3Q61789 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lama3Q61789 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lama3Q61789 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lama3Q61789 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Lama3Q61789 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lama3Q61789 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms