Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Itga6Q61739 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Itga6Q61739 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Itga6Q61739 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Itga6Q61739 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Itga6Q61739 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Itga6Q61739 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Itga6Q61739 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Itga6Q61739 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Itga6Q61739 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Itga6Q61739 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Itga6Q61739 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Itga6Q61739 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Itga6Q61739 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Itga6Q61739 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Itga6Q61739 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Itga6Q61739 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Itga6Q61739 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Itga6Q61739 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Itga6Q61739 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Itga6Q61739 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Itga6Q61739 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Itga6Q61739 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Itga6Q61739 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Itga6Q61739 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Itga6Q61739 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Itga6Q61739 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Itga6Q61739 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Itga6Q61739 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Itga6Q61739 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Itga6Q61739 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Itga6Q61739 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms