Protein–RNA interactions for Protein: Q61553

Fscn1, Fascin, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn1Q61553 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fscn1Q61553 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fscn1Q61553 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fscn1Q61553 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fscn1Q61553 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fscn1Q61553 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fscn1Q61553 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
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Fscn1Q61553 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
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Fscn1Q61553 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
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Fscn1Q61553 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
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Fscn1Q61553 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fscn1Q61553 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fscn1Q61553 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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Fscn1Q61553 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Fscn1Q61553 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fscn1Q61553 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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Fscn1Q61553 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fscn1Q61553 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
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Fscn1Q61553 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
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Fscn1Q61553 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fscn1Q61553 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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Fscn1Q61553 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
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Fscn1Q61553 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fscn1Q61553 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fscn1Q61553 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fscn1Q61553 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fscn1Q61553 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fscn1Q61553 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fscn1Q61553 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
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Fscn1Q61553 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fscn1Q61553 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fscn1Q61553 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fscn1Q61553 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fscn1Q61553 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fscn1Q61553 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fscn1Q61553 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fscn1Q61553 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fscn1Q61553 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fscn1Q61553 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fscn1Q61553 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fscn1Q61553 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fscn1Q61553 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fscn1Q61553 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fscn1Q61553 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Fscn1Q61553 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms