Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim25Q61510 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim25Q61510 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim25Q61510 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim25Q61510 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim25Q61510 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim25Q61510 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim25Q61510 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim25Q61510 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim25Q61510 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim25Q61510 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim25Q61510 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim25Q61510 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim25Q61510 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim25Q61510 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim25Q61510 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim25Q61510 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim25Q61510 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim25Q61510 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim25Q61510 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim25Q61510 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim25Q61510 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim25Q61510 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim25Q61510 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim25Q61510 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim25Q61510 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim25Q61510 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim25Q61510 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim25Q61510 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim25Q61510 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim25Q61510 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim25Q61510 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim25Q61510 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim25Q61510 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim25Q61510 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim25Q61510 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim25Q61510 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim25Q61510 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim25Q61510 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim25Q61510 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim25Q61510 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim25Q61510 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms