Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcd1Q61466 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcd1Q61466 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcd1Q61466 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcd1Q61466 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcd1Q61466 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcd1Q61466 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcd1Q61466 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcd1Q61466 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcd1Q61466 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcd1Q61466 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcd1Q61466 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcd1Q61466 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcd1Q61466 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcd1Q61466 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcd1Q61466 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcd1Q61466 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcd1Q61466 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcd1Q61466 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcd1Q61466 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarcd1Q61466 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarcd1Q61466 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcd1Q61466 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarcd1Q61466 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcd1Q61466 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcd1Q61466 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcd1Q61466 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcd1Q61466 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcd1Q61466 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcd1Q61466 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcd1Q61466 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcd1Q61466 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcd1Q61466 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcd1Q61466 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcd1Q61466 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcd1Q61466 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcd1Q61466 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcd1Q61466 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcd1Q61466 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcd1Q61466 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcd1Q61466 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcd1Q61466 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcd1Q61466 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcd1Q61466 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcd1Q61466 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcd1Q61466 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcd1Q61466 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcd1Q61466 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcd1Q61466 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcd1Q61466 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcd1Q61466 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcd1Q61466 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcd1Q61466 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcd1Q61466 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarcd1Q61466 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarcd1Q61466 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarcd1Q61466 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarcd1Q61466 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcd1Q61466 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcd1Q61466 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcd1Q61466 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcd1Q61466 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcd1Q61466 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcd1Q61466 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcd1Q61466 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcd1Q61466 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms