Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hif1aQ61221 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hif1aQ61221 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hif1aQ61221 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.9 ms