Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prpf4bQ61136 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prpf4bQ61136 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prpf4bQ61136 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prpf4bQ61136 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prpf4bQ61136 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prpf4bQ61136 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prpf4bQ61136 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prpf4bQ61136 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prpf4bQ61136 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prpf4bQ61136 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prpf4bQ61136 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prpf4bQ61136 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Prpf4bQ61136 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prpf4bQ61136 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prpf4bQ61136 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prpf4bQ61136 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prpf4bQ61136 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prpf4bQ61136 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prpf4bQ61136 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prpf4bQ61136 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prpf4bQ61136 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prpf4bQ61136 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prpf4bQ61136 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Prpf4bQ61136 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Prpf4bQ61136 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prpf4bQ61136 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prpf4bQ61136 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prpf4bQ61136 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prpf4bQ61136 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prpf4bQ61136 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prpf4bQ61136 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Prpf4bQ61136 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prpf4bQ61136 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Prpf4bQ61136 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prpf4bQ61136 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prpf4bQ61136 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prpf4bQ61136 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms