Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd6Q61003 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd6Q61003 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd6Q61003 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd6Q61003 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd6Q61003 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd6Q61003 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd6Q61003 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd6Q61003 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd6Q61003 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd6Q61003 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd6Q61003 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd6Q61003 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd6Q61003 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd6Q61003 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd6Q61003 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd6Q61003 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd6Q61003 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd6Q61003 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd6Q61003 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd6Q61003 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd6Q61003 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd6Q61003 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd6Q61003 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd6Q61003 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd6Q61003 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd6Q61003 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd6Q61003 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd6Q61003 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd6Q61003 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd6Q61003 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd6Q61003 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd6Q61003 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd6Q61003 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd6Q61003 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd6Q61003 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd6Q61003 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd6Q61003 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd6Q61003 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd6Q61003 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd6Q61003 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd6Q61003 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd6Q61003 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd6Q61003 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd6Q61003 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd6Q61003 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd6Q61003 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd6Q61003 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd6Q61003 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd6Q61003 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd6Q61003 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd6Q61003 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd6Q61003 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd6Q61003 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd6Q61003 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd6Q61003 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd6Q61003 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd6Q61003 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd6Q61003 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd6Q61003 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd6Q61003 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd6Q61003 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd6Q61003 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd6Q61003 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd6Q61003 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd6Q61003 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd6Q61003 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd6Q61003 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd6Q61003 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd6Q61003 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cd6Q61003 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd6Q61003 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd6Q61003 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms