Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Grik1Q60934 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grik1Q60934 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grik1Q60934 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grik1Q60934 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grik1Q60934 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grik1Q60934 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Grik1Q60934 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grik1Q60934 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik1Q60934 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik1Q60934 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik1Q60934 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik1Q60934 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grik1Q60934 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grik1Q60934 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grik1Q60934 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grik1Q60934 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grik1Q60934 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Grik1Q60934 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grik1Q60934 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik1Q60934 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik1Q60934 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms