Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vdac1Q60932 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vdac1Q60932 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vdac1Q60932 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vdac1Q60932 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vdac1Q60932 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vdac1Q60932 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vdac1Q60932 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vdac1Q60932 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vdac1Q60932 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vdac1Q60932 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vdac1Q60932 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vdac1Q60932 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vdac1Q60932 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vdac1Q60932 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vdac1Q60932 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vdac1Q60932 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Vdac1Q60932 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vdac1Q60932 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.3 ms