Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NfkbibQ60778 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NfkbibQ60778 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NfkbibQ60778 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NfkbibQ60778 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NfkbibQ60778 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NfkbibQ60778 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NfkbibQ60778 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NfkbibQ60778 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NfkbibQ60778 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NfkbibQ60778 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NfkbibQ60778 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NfkbibQ60778 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NfkbibQ60778 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NfkbibQ60778 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NfkbibQ60778 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NfkbibQ60778 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NfkbibQ60778 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NfkbibQ60778 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NfkbibQ60778 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NfkbibQ60778 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NfkbibQ60778 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NfkbibQ60778 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NfkbibQ60778 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NfkbibQ60778 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NfkbibQ60778 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NfkbibQ60778 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NfkbibQ60778 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NfkbibQ60778 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NfkbibQ60778 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NfkbibQ60778 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NfkbibQ60778 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NfkbibQ60778 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NfkbibQ60778 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NfkbibQ60778 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NfkbibQ60778 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms