Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdkn2dQ60773 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdkn2dQ60773 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdkn2dQ60773 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdkn2dQ60773 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdkn2dQ60773 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cdkn2dQ60773 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkn2dQ60773 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkn2dQ60773 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkn2dQ60773 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkn2dQ60773 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkn2dQ60773 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkn2dQ60773 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkn2dQ60773 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkn2dQ60773 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkn2dQ60773 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkn2dQ60773 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkn2dQ60773 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkn2dQ60773 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkn2dQ60773 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkn2dQ60773 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkn2dQ60773 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkn2dQ60773 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms