Protein–RNA interactions for Protein: Q60720

Cyb561, Cytochrome b561, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561Q60720 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyb561Q60720 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyb561Q60720 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyb561Q60720 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms