Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SkiQ60698 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SkiQ60698 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SkiQ60698 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SkiQ60698 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SkiQ60698 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SkiQ60698 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SkiQ60698 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SkiQ60698 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SkiQ60698 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SkiQ60698 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SkiQ60698 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SkiQ60698 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SkiQ60698 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SkiQ60698 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SkiQ60698 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SkiQ60698 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SkiQ60698 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SkiQ60698 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SkiQ60698 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SkiQ60698 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SkiQ60698 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SkiQ60698 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SkiQ60698 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms