Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxd4Q60688 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxd4Q60688 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxd4Q60688 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxd4Q60688 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxd4Q60688 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxd4Q60688 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd4Q60688 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd4Q60688 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd4Q60688 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd4Q60688 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd4Q60688 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxd4Q60688 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxd4Q60688 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxd4Q60688 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxd4Q60688 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxd4Q60688 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Foxd4Q60688 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Foxd4Q60688 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Foxd4Q60688 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Foxd4Q60688 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms