Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Satb1Q60611 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Satb1Q60611 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Satb1Q60611 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Satb1Q60611 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Satb1Q60611 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Satb1Q60611 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Satb1Q60611 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Satb1Q60611 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Satb1Q60611 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Satb1Q60611 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Satb1Q60611 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Satb1Q60611 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Satb1Q60611 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Satb1Q60611 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms