Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MALRD1Q5VYJ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MALRD1Q5VYJ5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
MALRD1Q5VYJ5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MALRD1Q5VYJ5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MALRD1Q5VYJ5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms