Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRCH2Q5VUJ6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRCH2Q5VUJ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRCH2Q5VUJ6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms