Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC39BQ5VTQ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTC39BQ5VTQ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTC39BQ5VTQ0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC39BQ5VTQ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC39BQ5VTQ0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC39BQ5VTQ0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC39BQ5VTQ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC39BQ5VTQ0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC39BQ5VTQ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC39BQ5VTQ0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC39BQ5VTQ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC39BQ5VTQ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC39BQ5VTQ0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC39BQ5VTQ0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC39BQ5VTQ0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC39BQ5VTQ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC39BQ5VTQ0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC39BQ5VTQ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC39BQ5VTQ0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC39BQ5VTQ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC39BQ5VTQ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms