Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
WDR78Q5VTH9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
WDR78Q5VTH9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
WDR78Q5VTH9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
WDR78Q5VTH9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
WDR78Q5VTH9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
WDR78Q5VTH9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
WDR78Q5VTH9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WDR78Q5VTH9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WDR78Q5VTH9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WDR78Q5VTH9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WDR78Q5VTH9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
WDR78Q5VTH9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WDR78Q5VTH9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
WDR78Q5VTH9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDR78Q5VTH9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDR78Q5VTH9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDR78Q5VTH9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
WDR78Q5VTH9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
WDR78Q5VTH9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
WDR78Q5VTH9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
WDR78Q5VTH9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
WDR78Q5VTH9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
WDR78Q5VTH9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
WDR78Q5VTH9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WDR78Q5VTH9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
WDR78Q5VTH9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WDR78Q5VTH9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
WDR78Q5VTH9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
WDR78Q5VTH9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
WDR78Q5VTH9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
WDR78Q5VTH9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
WDR78Q5VTH9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
WDR78Q5VTH9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
WDR78Q5VTH9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
WDR78Q5VTH9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
WDR78Q5VTH9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
WDR78Q5VTH9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
WDR78Q5VTH9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
WDR78Q5VTH9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
WDR78Q5VTH9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
WDR78Q5VTH9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms