Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
OBSCNQ5VST9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms