Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q5VSD8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q5VSD8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q5VSD8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q5VSD8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q5VSD8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q5VSD8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q5VSD8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q5VSD8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q5VSD8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q5VSD8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q5VSD8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q5VSD8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q5VSD8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q5VSD8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q5VSD8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q5VSD8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q5VSD8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q5VSD8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q5VSD8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q5VSD8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q5VSD8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q5VSD8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q5VSD8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q5VSD8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q5VSD8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q5VSD8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q5VSD8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q5VSD8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q5VSD8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q5VSD8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q5VSD8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q5VSD8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q5VSD8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q5VSD8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q5VSD8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q5VSD8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q5VSD8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q5VSD8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q5VSD8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Q5VSD8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q5VSD8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q5VSD8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q5VSD8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q5VSD8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q5VSD8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q5VSD8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q5VSD8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q5VSD8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q5VSD8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q5VSD8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q5VSD8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q5VSD8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q5VSD8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q5VSD8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q5VSD8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q5VSD8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q5VSD8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q5VSD8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q5VSD8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q5VSD8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q5VSD8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q5VSD8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q5VSD8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q5VSD8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q5VSD8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q5VSD8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q5VSD8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q5VSD8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q5VSD8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q5VSD8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q5VSD8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q5VSD8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q5VSD8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q5VSD8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q5VSD8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q5VSD8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q5VSD8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q5VSD8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q5VSD8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q5VSD8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q5VSD8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q5VSD8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q5VSD8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q5VSD8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q5VSD8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q5VSD8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q5VSD8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q5VSD8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q5VSD8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q5VSD8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q5VSD8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q5VSD8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q5VSD8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q5VSD8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q5VSD8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q5VSD8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q5VSD8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q5VSD8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q5VSD8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms