Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RSPH4AQ5TD94 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
RSPH4AQ5TD94 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
RSPH4AQ5TD94 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RSPH4AQ5TD94 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
RSPH4AQ5TD94 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
RSPH4AQ5TD94 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
RSPH4AQ5TD94 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
RSPH4AQ5TD94 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
RSPH4AQ5TD94 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
RSPH4AQ5TD94 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
RSPH4AQ5TD94 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
RSPH4AQ5TD94 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
RSPH4AQ5TD94 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
RSPH4AQ5TD94 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
RSPH4AQ5TD94 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
RSPH4AQ5TD94 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
RSPH4AQ5TD94 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
RSPH4AQ5TD94 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
RSPH4AQ5TD94 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
RSPH4AQ5TD94 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.21■■■■□ 3.71
RSPH4AQ5TD94 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC38.2■■■■□ 3.71
RSPH4AQ5TD94 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
RSPH4AQ5TD94 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
RSPH4AQ5TD94 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
RSPH4AQ5TD94 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
RSPH4AQ5TD94 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
RSPH4AQ5TD94 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
RSPH4AQ5TD94 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
RSPH4AQ5TD94 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
RSPH4AQ5TD94 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
RSPH4AQ5TD94 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
RSPH4AQ5TD94 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
RSPH4AQ5TD94 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
RSPH4AQ5TD94 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
RSPH4AQ5TD94 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
RSPH4AQ5TD94 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
RSPH4AQ5TD94 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
RSPH4AQ5TD94 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
RSPH4AQ5TD94 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
RSPH4AQ5TD94 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
RSPH4AQ5TD94 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
RSPH4AQ5TD94 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
RSPH4AQ5TD94 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
RSPH4AQ5TD94 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
RSPH4AQ5TD94 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
RSPH4AQ5TD94 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
RSPH4AQ5TD94 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
RSPH4AQ5TD94 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.1■■■■□ 3.69
RSPH4AQ5TD94 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
RSPH4AQ5TD94 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
RSPH4AQ5TD94 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
RSPH4AQ5TD94 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
RSPH4AQ5TD94 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
RSPH4AQ5TD94 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
RSPH4AQ5TD94 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
RSPH4AQ5TD94 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
RSPH4AQ5TD94 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
RSPH4AQ5TD94 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
RSPH4AQ5TD94 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
RSPH4AQ5TD94 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RSPH4AQ5TD94 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RSPH4AQ5TD94 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
RSPH4AQ5TD94 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RSPH4AQ5TD94 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
RSPH4AQ5TD94 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
RSPH4AQ5TD94 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RSPH4AQ5TD94 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RSPH4AQ5TD94 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RSPH4AQ5TD94 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
RSPH4AQ5TD94 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RSPH4AQ5TD94 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RSPH4AQ5TD94 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
RSPH4AQ5TD94 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
RSPH4AQ5TD94 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
RSPH4AQ5TD94 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
RSPH4AQ5TD94 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
RSPH4AQ5TD94 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
RSPH4AQ5TD94 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms