Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5Y3

CAMSAP1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP1Q5T5Y3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
CAMSAP1Q5T5Y3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CAMSAP1Q5T5Y3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CAMSAP1Q5T5Y3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CAMSAP1Q5T5Y3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CAMSAP1Q5T5Y3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CAMSAP1Q5T5Y3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CAMSAP1Q5T5Y3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CAMSAP1Q5T5Y3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CAMSAP1Q5T5Y3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms