Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNYL2Q5T2Q4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNYL2Q5T2Q4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNYL2Q5T2Q4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNYL2Q5T2Q4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNYL2Q5T2Q4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNYL2Q5T2Q4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNYL2Q5T2Q4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNYL2Q5T2Q4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNYL2Q5T2Q4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNYL2Q5T2Q4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNYL2Q5T2Q4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNYL2Q5T2Q4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNYL2Q5T2Q4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNYL2Q5T2Q4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNYL2Q5T2Q4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNYL2Q5T2Q4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNYL2Q5T2Q4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNYL2Q5T2Q4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNYL2Q5T2Q4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCNYL2Q5T2Q4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNYL2Q5T2Q4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNYL2Q5T2Q4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNYL2Q5T2Q4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNYL2Q5T2Q4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNYL2Q5T2Q4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNYL2Q5T2Q4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNYL2Q5T2Q4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNYL2Q5T2Q4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNYL2Q5T2Q4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNYL2Q5T2Q4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms