Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAPPC3LQ5T215 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAPPC3LQ5T215 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAPPC3LQ5T215 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAPPC3LQ5T215 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAPPC3LQ5T215 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAPPC3LQ5T215 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAPPC3LQ5T215 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAPPC3LQ5T215 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRAPPC3LQ5T215 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC3LQ5T215 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC3LQ5T215 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC3LQ5T215 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC3LQ5T215 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC3LQ5T215 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRAPPC3LQ5T215 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRAPPC3LQ5T215 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAPPC3LQ5T215 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAPPC3LQ5T215 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAPPC3LQ5T215 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAPPC3LQ5T215 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRAPPC3LQ5T215 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRAPPC3LQ5T215 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRAPPC3LQ5T215 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRAPPC3LQ5T215 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRAPPC3LQ5T215 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TRAPPC3LQ5T215 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRAPPC3LQ5T215 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRAPPC3LQ5T215 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAPPC3LQ5T215 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAPPC3LQ5T215 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAPPC3LQ5T215 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAPPC3LQ5T215 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAPPC3LQ5T215 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAPPC3LQ5T215 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAPPC3LQ5T215 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRAPPC3LQ5T215 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRAPPC3LQ5T215 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAPPC3LQ5T215 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAPPC3LQ5T215 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAPPC3LQ5T215 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRAPPC3LQ5T215 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRAPPC3LQ5T215 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRAPPC3LQ5T215 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRAPPC3LQ5T215 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRAPPC3LQ5T215 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRAPPC3LQ5T215 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAPPC3LQ5T215 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAPPC3LQ5T215 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAPPC3LQ5T215 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAPPC3LQ5T215 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAPPC3LQ5T215 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAPPC3LQ5T215 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAPPC3LQ5T215 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAPPC3LQ5T215 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAPPC3LQ5T215 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRAPPC3LQ5T215 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms