Protein–RNA interactions for Protein: Q5T200

ZC3H13, Zinc finger CCCH domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H13Q5T200 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.43■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ZC3H13Q5T200 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ZC3H13Q5T200 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ZC3H13Q5T200 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ZC3H13Q5T200 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ZC3H13Q5T200 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ZC3H13Q5T200 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ZC3H13Q5T200 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ZC3H13Q5T200 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ZC3H13Q5T200 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ZC3H13Q5T200 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ZC3H13Q5T200 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
ZC3H13Q5T200 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ZC3H13Q5T200 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ZC3H13Q5T200 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ZC3H13Q5T200 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ZC3H13Q5T200 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ZC3H13Q5T200 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ZC3H13Q5T200 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ZC3H13Q5T200 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ZC3H13Q5T200 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ZC3H13Q5T200 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ZC3H13Q5T200 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ZC3H13Q5T200 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ZC3H13Q5T200 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ZC3H13Q5T200 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ZC3H13Q5T200 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ZC3H13Q5T200 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ZC3H13Q5T200 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ZC3H13Q5T200 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ZC3H13Q5T200 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ZC3H13Q5T200 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ZC3H13Q5T200 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ZC3H13Q5T200 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ZC3H13Q5T200 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ZC3H13Q5T200 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ZC3H13Q5T200 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
ZC3H13Q5T200 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ZC3H13Q5T200 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ZC3H13Q5T200 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ZC3H13Q5T200 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
ZC3H13Q5T200 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ZC3H13Q5T200 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ZC3H13Q5T200 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ZC3H13Q5T200 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ZC3H13Q5T200 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ZC3H13Q5T200 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ZC3H13Q5T200 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ZC3H13Q5T200 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ZC3H13Q5T200 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ZC3H13Q5T200 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
ZC3H13Q5T200 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ZC3H13Q5T200 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ZC3H13Q5T200 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
ZC3H13Q5T200 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ZC3H13Q5T200 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ZC3H13Q5T200 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ZC3H13Q5T200 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ZC3H13Q5T200 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ZC3H13Q5T200 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ZC3H13Q5T200 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ZC3H13Q5T200 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ZC3H13Q5T200 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ZC3H13Q5T200 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ZC3H13Q5T200 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ZC3H13Q5T200 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ZC3H13Q5T200 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
ZC3H13Q5T200 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ZC3H13Q5T200 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
ZC3H13Q5T200 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
ZC3H13Q5T200 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ZC3H13Q5T200 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ZC3H13Q5T200 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ZC3H13Q5T200 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ZC3H13Q5T200 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
ZC3H13Q5T200 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ZC3H13Q5T200 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms