Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1Q4

SLC35F1, Solute carrier family 35 member F1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F1Q5T1Q4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC35F1Q5T1Q4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35F1Q5T1Q4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35F1Q5T1Q4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC35F1Q5T1Q4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35F1Q5T1Q4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35F1Q5T1Q4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35F1Q5T1Q4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35F1Q5T1Q4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35F1Q5T1Q4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35F1Q5T1Q4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35F1Q5T1Q4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35F1Q5T1Q4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35F1Q5T1Q4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35F1Q5T1Q4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35F1Q5T1Q4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35F1Q5T1Q4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35F1Q5T1Q4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms