Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFAP70Q5T0N1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFAP70Q5T0N1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFAP70Q5T0N1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFAP70Q5T0N1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CFAP70Q5T0N1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CFAP70Q5T0N1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
CFAP70Q5T0N1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CFAP70Q5T0N1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CFAP70Q5T0N1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CFAP70Q5T0N1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CFAP70Q5T0N1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CFAP70Q5T0N1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFAP70Q5T0N1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
CFAP70Q5T0N1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CFAP70Q5T0N1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CFAP70Q5T0N1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFAP70Q5T0N1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CFAP70Q5T0N1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CFAP70Q5T0N1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CFAP70Q5T0N1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CFAP70Q5T0N1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CFAP70Q5T0N1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CFAP70Q5T0N1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CFAP70Q5T0N1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CFAP70Q5T0N1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CFAP70Q5T0N1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CFAP70Q5T0N1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CFAP70Q5T0N1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CFAP70Q5T0N1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
CFAP70Q5T0N1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CFAP70Q5T0N1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CFAP70Q5T0N1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms