Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.5 ms