Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.78■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
FRMPD1Q5SYB0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
FRMPD1Q5SYB0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
FRMPD1Q5SYB0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
FRMPD1Q5SYB0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
FRMPD1Q5SYB0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
FRMPD1Q5SYB0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
FRMPD1Q5SYB0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
FRMPD1Q5SYB0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
FRMPD1Q5SYB0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
FRMPD1Q5SYB0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
FRMPD1Q5SYB0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
FRMPD1Q5SYB0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
FRMPD1Q5SYB0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
FRMPD1Q5SYB0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
FRMPD1Q5SYB0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
FRMPD1Q5SYB0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
FRMPD1Q5SYB0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
FRMPD1Q5SYB0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
FRMPD1Q5SYB0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
FRMPD1Q5SYB0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
FRMPD1Q5SYB0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
FRMPD1Q5SYB0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
FRMPD1Q5SYB0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
FRMPD1Q5SYB0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
FRMPD1Q5SYB0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
FRMPD1Q5SYB0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
FRMPD1Q5SYB0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
FRMPD1Q5SYB0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
FRMPD1Q5SYB0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.64■■■■□ 3.78
FRMPD1Q5SYB0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
FRMPD1Q5SYB0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
FRMPD1Q5SYB0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
FRMPD1Q5SYB0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
FRMPD1Q5SYB0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
FRMPD1Q5SYB0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
FRMPD1Q5SYB0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
FRMPD1Q5SYB0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
FRMPD1Q5SYB0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
FRMPD1Q5SYB0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
FRMPD1Q5SYB0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
FRMPD1Q5SYB0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
FRMPD1Q5SYB0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
FRMPD1Q5SYB0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
FRMPD1Q5SYB0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
FRMPD1Q5SYB0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
FRMPD1Q5SYB0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
FRMPD1Q5SYB0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
FRMPD1Q5SYB0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
FRMPD1Q5SYB0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.5■■■■□ 3.75
FRMPD1Q5SYB0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
FRMPD1Q5SYB0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
FRMPD1Q5SYB0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
FRMPD1Q5SYB0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms