Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Specc1Q5SXY1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Specc1Q5SXY1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Specc1Q5SXY1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Specc1Q5SXY1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Specc1Q5SXY1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Specc1Q5SXY1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Specc1Q5SXY1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Specc1Q5SXY1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Specc1Q5SXY1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Specc1Q5SXY1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Specc1Q5SXY1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Specc1Q5SXY1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Specc1Q5SXY1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Specc1Q5SXY1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Specc1Q5SXY1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Specc1Q5SXY1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Specc1Q5SXY1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Specc1Q5SXY1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Specc1Q5SXY1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Specc1Q5SXY1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Specc1Q5SXY1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Specc1Q5SXY1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Specc1Q5SXY1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Specc1Q5SXY1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Specc1Q5SXY1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Specc1Q5SXY1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Specc1Q5SXY1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Specc1Q5SXY1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Specc1Q5SXY1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Specc1Q5SXY1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Specc1Q5SXY1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Specc1Q5SXY1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Specc1Q5SXY1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Specc1Q5SXY1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms