Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Myh1Q5SX40 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Myh1Q5SX40 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Myh1Q5SX40 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Myh1Q5SX40 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Myh1Q5SX40 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Myh1Q5SX40 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Myh1Q5SX40 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Myh1Q5SX40 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Myh1Q5SX40 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Myh1Q5SX40 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Myh1Q5SX40 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Myh1Q5SX40 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Myh1Q5SX40 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Myh1Q5SX40 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Myh1Q5SX40 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Myh1Q5SX40 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Myh1Q5SX40 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Myh1Q5SX40 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Myh1Q5SX40 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Myh1Q5SX40 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Myh1Q5SX40 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Myh1Q5SX40 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Myh1Q5SX40 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Myh1Q5SX40 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Myh1Q5SX40 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Myh1Q5SX40 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Myh1Q5SX40 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Myh1Q5SX40 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Myh1Q5SX40 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Myh1Q5SX40 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Myh1Q5SX40 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Myh1Q5SX40 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Myh1Q5SX40 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Myh1Q5SX40 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Myh1Q5SX40 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myh1Q5SX40 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myh1Q5SX40 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myh1Q5SX40 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Myh1Q5SX40 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Myh1Q5SX40 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Myh1Q5SX40 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Myh1Q5SX40 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Myh1Q5SX40 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Myh1Q5SX40 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myh1Q5SX40 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Myh1Q5SX40 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Myh1Q5SX40 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Myh1Q5SX40 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Myh1Q5SX40 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Myh1Q5SX40 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Myh1Q5SX40 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Myh1Q5SX40 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Myh1Q5SX40 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Myh1Q5SX40 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Myh1Q5SX40 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Myh1Q5SX40 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Myh1Q5SX40 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Myh1Q5SX40 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Myh1Q5SX40 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Myh1Q5SX40 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Myh1Q5SX40 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Myh1Q5SX40 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Myh1Q5SX40 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Myh1Q5SX40 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Myh1Q5SX40 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Myh1Q5SX40 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Myh1Q5SX40 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Myh1Q5SX40 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Myh1Q5SX40 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Myh1Q5SX40 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Myh1Q5SX40 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Myh1Q5SX40 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Myh1Q5SX40 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myh1Q5SX40 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms