Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Psme4Q5SSW2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Psme4Q5SSW2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Psme4Q5SSW2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Psme4Q5SSW2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Psme4Q5SSW2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Psme4Q5SSW2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Psme4Q5SSW2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Psme4Q5SSW2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Psme4Q5SSW2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psme4Q5SSW2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psme4Q5SSW2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Psme4Q5SSW2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Psme4Q5SSW2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Psme4Q5SSW2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Psme4Q5SSW2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Psme4Q5SSW2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Psme4Q5SSW2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Psme4Q5SSW2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Psme4Q5SSW2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Psme4Q5SSW2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Psme4Q5SSW2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Psme4Q5SSW2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psme4Q5SSW2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Psme4Q5SSW2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psme4Q5SSW2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psme4Q5SSW2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psme4Q5SSW2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psme4Q5SSW2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Psme4Q5SSW2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Psme4Q5SSW2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Psme4Q5SSW2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Psme4Q5SSW2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psme4Q5SSW2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psme4Q5SSW2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psme4Q5SSW2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psme4Q5SSW2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psme4Q5SSW2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Psme4Q5SSW2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Psme4Q5SSW2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Psme4Q5SSW2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psme4Q5SSW2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Psme4Q5SSW2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Psme4Q5SSW2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Psme4Q5SSW2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Psme4Q5SSW2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Psme4Q5SSW2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Psme4Q5SSW2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Psme4Q5SSW2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Psme4Q5SSW2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Psme4Q5SSW2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Psme4Q5SSW2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Psme4Q5SSW2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Psme4Q5SSW2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Psme4Q5SSW2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Psme4Q5SSW2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Psme4Q5SSW2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Psme4Q5SSW2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psme4Q5SSW2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psme4Q5SSW2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psme4Q5SSW2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Psme4Q5SSW2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Psme4Q5SSW2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Psme4Q5SSW2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Psme4Q5SSW2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psme4Q5SSW2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psme4Q5SSW2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Psme4Q5SSW2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Psme4Q5SSW2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Psme4Q5SSW2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Psme4Q5SSW2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Psme4Q5SSW2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Psme4Q5SSW2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Psme4Q5SSW2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Psme4Q5SSW2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Psme4Q5SSW2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Psme4Q5SSW2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Psme4Q5SSW2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Psme4Q5SSW2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms