Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2D4BQ5SQS7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D4BQ5SQS7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D4BQ5SQS7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D4BQ5SQS7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D4BQ5SQS7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D4BQ5SQS7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D4BQ5SQS7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D4BQ5SQS7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D4BQ5SQS7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D4BQ5SQS7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D4BQ5SQS7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D4BQ5SQS7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2D4BQ5SQS7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2D4BQ5SQS7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2D4BQ5SQS7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2D4BQ5SQS7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms