Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms