Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trdv4Q5R1A3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trdv4Q5R1A3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trdv4Q5R1A3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms