Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms