Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rapgef6Q5NCJ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rapgef6Q5NCJ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Rapgef6Q5NCJ1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rapgef6Q5NCJ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rapgef6Q5NCJ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rapgef6Q5NCJ1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rapgef6Q5NCJ1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rapgef6Q5NCJ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rapgef6Q5NCJ1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rapgef6Q5NCJ1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rapgef6Q5NCJ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rapgef6Q5NCJ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rapgef6Q5NCJ1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rapgef6Q5NCJ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rapgef6Q5NCJ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rapgef6Q5NCJ1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Rapgef6Q5NCJ1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rapgef6Q5NCJ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rapgef6Q5NCJ1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rapgef6Q5NCJ1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rapgef6Q5NCJ1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rapgef6Q5NCJ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Rapgef6Q5NCJ1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rapgef6Q5NCJ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rapgef6Q5NCJ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rapgef6Q5NCJ1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rapgef6Q5NCJ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Rapgef6Q5NCJ1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rapgef6Q5NCJ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rapgef6Q5NCJ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rapgef6Q5NCJ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rapgef6Q5NCJ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Rapgef6Q5NCJ1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Rapgef6Q5NCJ1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Rapgef6Q5NCJ1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rapgef6Q5NCJ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rapgef6Q5NCJ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rapgef6Q5NCJ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rapgef6Q5NCJ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rapgef6Q5NCJ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rapgef6Q5NCJ1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rapgef6Q5NCJ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rapgef6Q5NCJ1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Rapgef6Q5NCJ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Rapgef6Q5NCJ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rapgef6Q5NCJ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rapgef6Q5NCJ1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rapgef6Q5NCJ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Rapgef6Q5NCJ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Rapgef6Q5NCJ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rapgef6Q5NCJ1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Rapgef6Q5NCJ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Rapgef6Q5NCJ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Rapgef6Q5NCJ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Rapgef6Q5NCJ1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Rapgef6Q5NCJ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rapgef6Q5NCJ1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rapgef6Q5NCJ1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rapgef6Q5NCJ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rapgef6Q5NCJ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rapgef6Q5NCJ1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Rapgef6Q5NCJ1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Rapgef6Q5NCJ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Rapgef6Q5NCJ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Rapgef6Q5NCJ1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Rapgef6Q5NCJ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Rapgef6Q5NCJ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Rapgef6Q5NCJ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Rapgef6Q5NCJ1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Rapgef6Q5NCJ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Rapgef6Q5NCJ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Rapgef6Q5NCJ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Rapgef6Q5NCJ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Rapgef6Q5NCJ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.4 ms