Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf38Q5JPI3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf38Q5JPI3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms