Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC4Q5J8M3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMC4Q5J8M3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMC4Q5J8M3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.2 ms