Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
HERC4Q5GLZ8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HERC4Q5GLZ8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HERC4Q5GLZ8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms