Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trpm3Q5F4S9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trpm3Q5F4S9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trpm3Q5F4S9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trpm3Q5F4S9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trpm3Q5F4S9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trpm3Q5F4S9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trpm3Q5F4S9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Trpm3Q5F4S9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trpm3Q5F4S9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trpm3Q5F4S9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trpm3Q5F4S9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Trpm3Q5F4S9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trpm3Q5F4S9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trpm3Q5F4S9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Trpm3Q5F4S9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Trpm3Q5F4S9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Trpm3Q5F4S9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trpm3Q5F4S9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trpm3Q5F4S9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trpm3Q5F4S9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trpm3Q5F4S9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trpm3Q5F4S9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trpm3Q5F4S9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trpm3Q5F4S9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Trpm3Q5F4S9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trpm3Q5F4S9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trpm3Q5F4S9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trpm3Q5F4S9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trpm3Q5F4S9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trpm3Q5F4S9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trpm3Q5F4S9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Trpm3Q5F4S9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Trpm3Q5F4S9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trpm3Q5F4S9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms