Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZC3H12AQ5D1E8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZC3H12AQ5D1E8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZC3H12AQ5D1E8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZC3H12AQ5D1E8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZC3H12AQ5D1E8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZC3H12AQ5D1E8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ZC3H12AQ5D1E8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZC3H12AQ5D1E8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZC3H12AQ5D1E8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZC3H12AQ5D1E8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ZC3H12AQ5D1E8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZC3H12AQ5D1E8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZC3H12AQ5D1E8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZC3H12AQ5D1E8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZC3H12AQ5D1E8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ZC3H12AQ5D1E8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ZC3H12AQ5D1E8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZC3H12AQ5D1E8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZC3H12AQ5D1E8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZC3H12AQ5D1E8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZC3H12AQ5D1E8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZC3H12AQ5D1E8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZC3H12AQ5D1E8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZC3H12AQ5D1E8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZC3H12AQ5D1E8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms