Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E7

Zc3h12a, Endoribonuclease ZC3H12A, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12aQ5D1E7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h12aQ5D1E7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h12aQ5D1E7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h12aQ5D1E7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h12aQ5D1E7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h12aQ5D1E7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h12aQ5D1E7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h12aQ5D1E7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h12aQ5D1E7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h12aQ5D1E7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h12aQ5D1E7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h12aQ5D1E7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h12aQ5D1E7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h12aQ5D1E7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h12aQ5D1E7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 493.7 ms