Protein–RNA interactions for Protein: Q5BIV9

SPRN, Shadow of prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRNQ5BIV9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRNQ5BIV9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRNQ5BIV9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRNQ5BIV9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRNQ5BIV9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRNQ5BIV9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRNQ5BIV9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRNQ5BIV9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRNQ5BIV9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPRNQ5BIV9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRNQ5BIV9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRNQ5BIV9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms