Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmtc2Q56A06 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmtc2Q56A06 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmtc2Q56A06 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmtc2Q56A06 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmtc2Q56A06 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmtc2Q56A06 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmtc2Q56A06 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmtc2Q56A06 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmtc2Q56A06 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmtc2Q56A06 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmtc2Q56A06 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmtc2Q56A06 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmtc2Q56A06 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmtc2Q56A06 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmtc2Q56A06 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmtc2Q56A06 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmtc2Q56A06 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmtc2Q56A06 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmtc2Q56A06 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmtc2Q56A06 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmtc2Q56A06 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmtc2Q56A06 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmtc2Q56A06 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmtc2Q56A06 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmtc2Q56A06 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmtc2Q56A06 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmtc2Q56A06 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmtc2Q56A06 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmtc2Q56A06 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmtc2Q56A06 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmtc2Q56A06 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmtc2Q56A06 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmtc2Q56A06 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmtc2Q56A06 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmtc2Q56A06 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmtc2Q56A06 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmtc2Q56A06 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmtc2Q56A06 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmtc2Q56A06 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmtc2Q56A06 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmtc2Q56A06 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmtc2Q56A06 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmtc2Q56A06 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmtc2Q56A06 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmtc2Q56A06 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmtc2Q56A06 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmtc2Q56A06 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmtc2Q56A06 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmtc2Q56A06 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmtc2Q56A06 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmtc2Q56A06 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmtc2Q56A06 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmtc2Q56A06 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmtc2Q56A06 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmtc2Q56A06 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmtc2Q56A06 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmtc2Q56A06 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tmtc2Q56A06 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tmtc2Q56A06 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tmtc2Q56A06 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmtc2Q56A06 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmtc2Q56A06 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmtc2Q56A06 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmtc2Q56A06 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmtc2Q56A06 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmtc2Q56A06 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmtc2Q56A06 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmtc2Q56A06 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmtc2Q56A06 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmtc2Q56A06 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms